Idrottsklubben Ymer är en förening med 11 olika sektioner. Klubben har ett organisationsnummer och lämnar en verksamhetsberättelse med gemensamt bokslut.
Klubbens högsta beslutande organ är årsmötet som äger rum i mars månad varje år. Där väljs en huvudstyrelse som består av 7 medlemmar samt 2 suppleanter med en spridning över sektionsgränserna. Huvudstyrelsen har ansvaret för klubbens ekonomi, personal och verksamhet inkluderande bl.a Ymergården.
Klubbens sektioner har egna styrelser och verksamheter med separata årsmöten.
IK Ymer är 2009 licensierad av Borås Stad som en Trygg och Säker förening.